東南亞華人宗教可以有兩種理解方式：第一，東南亞的華人宗教，本課程的前一部份，將從馬來西亞、新加坡、印尼、泰國等地的華人宗教論文選讀，以及孔教、德教、先天道、一貫道等華人民間教派的研究出發，討論並理解這些不同教派在相異國家地域的發展。第二，東南亞華人的宗教，本課程後半部，不侷限於華人宗教，而討論東南亞華人在華人宗教外的不同宗教實踐；在這一部分，會討論華人與基督教、伊斯蘭教等制度宗教的關係。